U Međimurskoj županiji se od 27. prosinca 2020. godine provodi cijepljenje protiv bolesti COVID-19 prema dokumentu “Plan uvođenja, provođenja i praćenja cijepljenja protiv bolesti COVID-19 u Hrvatskoj” kojeg je izdalo Ministarstvo zdravstva. Prema planu, cijepljenje provode liječnici spec. epidemiolozi te liječnici obiteljske medicine i liječnici u ŽB Čakovec,a u skladu s navedenim dokumentom, cijepljenje se odvija u tri faze prema prioritetima.
U prvoj fazi se cijepe zdravstveni radnici, korisnici domova za starije osobe i zaposlenici u domovima. U drugoj fazi cijepit će se kronični bolesnici i osobe starije od 65 godina, dok će se građani moći cijepiti u trećoj fazi. Građani koji se žele cijepiti, posebice osobe starije od 65 godina i kronični bolesnici, mogu se javiti svojim liječnicima obiteljske medicine te se pribilježiti za cijepljenje. Svima zainteresiranima za cijepljenje omogućeno je i javljanje u pozivni centar na broj telefona 040/372-350.
Do 13. siječnja 2021. u Međimurju je cijepljeno 1458 osoba. Danas, 14. siječnja će se cijepiti 216 osoba, što će ukupno biti 1674 cijepljenih osoba. Svi su cijepljeni Pfizer/BioNTech cjepivom i nisu zabilježene ozbiljne nuspojave. S današnjim danom cijepljeno je 1,5% stanovništva Međimurja.